南阳村镇银行实行在董事会领导下的行长负责制。高级管理层由行长、副行长、行长助理等高级管理人员组成。行长由董事长提名，董事会聘任；副行长等高管人员由行长提名，董事会聘任。高级管理层与董事长、监事长、董事会秘书共同组成南阳村镇银行的经营管理团队。